Отдел прогноза АПК и развития межрегиональных продовольственных связей

Руководитель отдела - Алтухов А.И., член-корреспондент РАСХН, д.э.н., профессор

Отдел многоукладной экономики АПК

Руководитель отдела - Югай А.М., заслуженный деятель науки РФ, д.э.н., профессор, академик РАЕН

Отдел аграрной политики и прогнозирования развития сельского хозяйства

Руководитель отдела – к.э.н. В.С. Чекалин

Отдел экономических проблем научно-технического прогресса в АПК

Руководитель отдела – Санду И.С., д.э.н., профессор

Отдел ценовых и финансово-кредитных отношений

Руководитель отдела – Борхунов Н.А., д.э.н.

Отдел аграрного маркетинга

Руководитель отдела – Магомедов А-Н.Д., к.э.н.

Отдел рынка средств производства и услуг

Руководитель отдела -  Алферьев В.П., заслуженный деятель науки РФ, д.э.н., профессор

Отдел экономики материально-технической базы АПК

Руководитель отдела – Драгайцев В.И., д.э.н.

Отдел внешнеэкономической деятельности

Руководитель отдела – Тарасов В.И., академик Академии информатизации, к.т.н., доцент

Центр всероссийского мониторинга социально-трудовой сферы села

Руководитель отдела – Бондаренко Л.В., член-корреспондент РАСХН, д.э.н., профессор

Центр информации и технико-экономических исследований АПК

Руководитель отдела – Папцов А.Г., д.э.н.

Отдел организации научно-технической деятельности в АПК

Руководитель отдела – Бондаренко Т.Г., к.э.н. 

Отдел аспирантуры

Руководитель отдела - Иларионова Г.А.

Северо-Восточный отдел ГНУ ВНИИЭСХ (г. Ижевск)

Руководитель отдела – Жуйков В.И., д.э.н.